El español Márquez líder del campeonato logró el mejor tiempo y fue escoltado por Crutchlow y Rossi
Primera pole en MotoGP para Marc Márquez. Ya la había hecho en Moto2, en 2012, y en 125, en 2010. Ya sólo le falta Motegi por conquistar en la clase reina. El catalán logró su segunda pole del año.
Márquez fue el más rápido con una vuelta de 1.32.791 en el fin de la clasificación dejando segundo a Cal Crutchlow por 0.041 con la Honda. Valentino Rossi ultimo ganador en este circuito finalizó tercero haciendo una gran clasificación con un tiempo de 1.32.850 a 0.059 del mejor tiempo.
Rossi pudo expresar lo siguiente:»ganar ahora será más difícil que el año pasado, ahora me siento mejor con la moto pero al mismo tiempo Ducati y Honda son más fuertes. Han mejorado mucho con respecto al año pasado»
Resultados de la Clasificación Moto GP Assen 2018:
| Posición | Piloto | Marca | Tiempo |
| 1 | Marc Márquez | 
Repsol Honda Team |
1:32.791 |
| 2 | Cal Crutchlow |  LCR Honda Castrol |
0.041 |
| 3 | Valentino Rossi |  Movistar Yamaha MotoGP |
0.079 |
| 4 | Andrea Dovizioso |  Ducati Team |
0.142 |
| 5 | Alex Rins |  Team Suzuki Ecstar |
0.193 |
| 6 | Maverick Viñales | Movistar Yamaha MotoGP |
0.238 |
| 7 | Aleix Espargaro | 
Aprilia Racing Team Gresini |
0.281 |
| 8 | Johann Zarco |  Monster Yamaha Tech 3 |
0.329 |
| 9 | Andrea Iannone | Team Suzuki Ecstar |
0.376 |
| 10 | Jorge Lorenzo | Ducati Team |
0.501 |
